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导师介绍

刘鹏渊

教授|博士生导师

转化医学研究院和医学院附属邵逸夫医院,教授

电话

86971657

邮箱

pyliu@zju.edu.cn

地址

华家池校区中心北楼602室

个人简介

        博士,2016年加盟浙江大学转化医学研究院以及医学院附属邵逸夫医院。回国前任威斯康辛医学院的副教授和担任其医学院系统分子医学中心的计算生物学负责人。主要从事生物信息学、基因组学和癌症遗传的研究。已在生物信息学等领域发表了118篇包括Nature GeneticsJNCIAJHGPNASNucleic Acids ResearchCancer ResearchOncogeneBioinformaticsSCI论文。2010年获教育部自然科学奖一等奖(第5完成人)。担任Physiological Genomics等杂志的编委、威斯康星医学院兼职教授、全国卫生产业企业管理协会精准医疗分会常务理事、浙江省生物信息学学会精准医学专业委员会副主委、浙江省数理医学会甲状腺疾病专委会副主委、浙江省数理医学会生物医学大数据专委会常务委员。获得国家自然科学基金面上项目3项、国家重点研发计划-精准医学1项(课题二主持)和国家重点研发计划1项(参与)。


代表性论文

1. Sun X#, Yang J#, Yu M#, Yao D, Zhou L, Li X, Qiu Q, Lin W, Lu B, Chen E, Wang P, Chen W, Tao S, Xu H, Williams A, Liu Y, Pan X, Cowley A, Jr, Lu W, Liang M, Liu P*, Lu Y*. Global identification and characterization of tRNA-derived RNA fragment landscapes across human cancers. NAR Cancer, Volume 2, Issue 4, December 2020, zcaa031.

2. Liu Y, Han Y, Zhou L, Pan X, Sun X, Liu Y, Liang M, Qin J*, Lu Y*, Liu P*. A comprehensive evaluation of computational tools to identify differential methylation regions using RRBS data. Genomics. 2020;112(6):4567-4576. doi:10.1016/j.ygeno.2020.07.032

3. Yao D, Sun X, Zhou L, Amanullah M, Pan X, Liu Y, Liang M, Liu P*, Lu Y*. OncotRF: an online resource for exploration of tRNA-derived fragments in human cancers. RNA Biol. 2020;17(8):1081-1091. doi:10.1080/15476286.2020.1776506.

4. Amanullah M#, Yu M#, Sun X#, Luo A, Zhou Q, Zhou L, Hou L, Wang W, Lu W, Liu P*, Lu Y*. MDEHT: a Multivariate Approach for Detecting Differential Expression of MicroRNA Isoform Data in RNA Sequencing Studies. Bioinformatics. 2020 May 1, 36(9):2657-2664.

5. Yang J#, Qiu Q#, Qian X, Yi J, Jiao Y, Yu M, Li X, Li J, Mi C, Zhang J, Lu B, Chen E, Liu P*, Lu Y. Long noncoding RNA LCAT1 functions as a ceRNA to regulate RAC1 function by sponging miR-4715-5p in lung cancer. Mol Cancer. 2019;18(1):171. Published 2019 Nov 29. doi:10.1186/s12943-019-1107-y (获得2020年中华医学会呼吸病学分会高影响力学术论文奖)




研究方向

  • · 生物信息学

  • · 基因组学

  • · 肿瘤分子遗传